當地時間9月18日晚些時候，吉爾吉斯斯坦報告稱，在與塔吉克斯坦的邊境沖突中又有13人死亡，使得該國在此次沖突中的死亡總人數達到59人，另有100多人受傷。
據英國廣播公司（BBC）9月19日報道，塔吉克斯坦方面則表示，沖突導致35名該國公民身亡，至少20人受傷。迄今為止，吉塔兩國的邊境沖突已導致至少94人死亡。吉爾吉斯斯坦宣布，9月19日為全國哀悼日，悼念在沖突中喪生的人。
9月14日，吉爾吉斯斯坦和塔吉克斯坦在邊境地區發生邊防軍交火事件。9月16日上午，這場沖突出現升級態勢，雙方互指對方動用重型武器。吉爾吉斯斯坦總統扎帕羅夫和塔吉克斯坦總統拉赫蒙16日在上合組織峰會期間舉行了會談，同意停火。然而，當晚雙方戰火再燃，并在17日繼續。
另據塔斯社9月18日報道，俄羅斯總統普京當天與扎帕羅夫和拉赫蒙通電話，呼吁雙方避免邊境局勢進一步升級。普京稱，雙方應“盡快通過和平、政治和外交手段”結束沖突。他還證實，俄方準備提供必要幫助，以確保吉塔兩國邊境地區的穩定。